28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4444 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  72.19 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  54.23 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  53.3 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  53.44 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  56.51 
 
 		 368 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  36.46 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  32.05 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  33.45 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  30.56 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  32.85 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  29.9 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  30.84 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  27.7 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  27.62 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  27.53 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  31.75 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  26.97 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  26.22 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  27.81 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  29.41 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  24.37 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  23.08 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  26.42 
 
 		 325 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  25.86 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  25.86 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25.57 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>