27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2378 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  29.01 
 
 
366 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  23.66 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.93 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  25.8 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  25.8 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  25.49 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  26.83 
 
 
368 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  27.99 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  25.49 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  22.46 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  25.25 
 
 
397 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  24.5 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  23.97 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  26.47 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  25.35 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2098  hypothetical protein  31.4 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234685  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1037  hypothetical protein  25.16 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  24.93 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  21.51 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  27.88 
 
 
338 aa  46.2  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  26.05 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  33.9 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  22.55 
 
 
414 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  25.57 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  24.91 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>