27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1869 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  98.64 
 
 
366 aa  718    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  91.58 
 
 
368 aa  675    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  733    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  60.62 
 
 
368 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  54.14 
 
 
365 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  53.3 
 
 
374 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  30.51 
 
 
343 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  33.79 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  30.29 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  29.15 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  27.41 
 
 
397 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  27.95 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  27.51 
 
 
394 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  28.75 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  30.11 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  23.99 
 
 
397 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  27.52 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  30.93 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  31.47 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  23.45 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25.49 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  25.58 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  31.54 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  28.79 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  28.79 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.42 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  29.35 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>