18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1585 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  732    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  29.01 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  27.49 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  22.46 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  27.37 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  25.13 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  25.58 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  26.03 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.3 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  22.46 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  25.39 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  22.46 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  22.66 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  25.95 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  21.78 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  23.41 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  21.14 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  22.65 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>