27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1649 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  91.85 
 
 
366 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  100 
 
 
368 aa  732    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  91.58 
 
 
367 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  59.84 
 
 
368 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  54.23 
 
 
374 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  54.95 
 
 
365 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  31.64 
 
 
343 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  33.91 
 
 
354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  32.06 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  31.02 
 
 
397 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  28.66 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  27.5 
 
 
395 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  25.68 
 
 
394 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  30.07 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  27.88 
 
 
337 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  28.06 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  27.52 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  31.95 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  32.07 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  26.44 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  23.61 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  26.83 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  25.83 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  27.61 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  27.61 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  31.52 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.36 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0604603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>