24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3577 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  92.9 
 
 
338 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  42.25 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  33.98 
 
 
335 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  30.18 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  24.92 
 
 
339 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  24.92 
 
 
339 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  24.42 
 
 
339 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  26.97 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  31.95 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  30 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  30.93 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  28.03 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  26.57 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  27.49 
 
 
368 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  28.97 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  23.33 
 
 
397 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  24.58 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  23.08 
 
 
394 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  27.78 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  27.88 
 
 
336 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  26.95 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  22.88 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>