21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4032 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  675    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  34.48 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  34.47 
 
 		 338 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  32.92 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  28.21 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  25.81 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  23.91 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  24.64 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  24.11 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  22.63 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  22.37 
 
 		 395 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  23.08 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  25.6 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  23.94 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  22.4 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  25.3 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  26.79 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  20.79 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  23.29 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  22.57 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  25.24 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>