28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2548 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  42.15 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  41.23 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  32.04 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  32.04 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  26.28 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  25.98 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  30.21 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  25.39 
 
 		 339 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  28.75 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  27.88 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  28.21 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  25.66 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  25.99 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  27.08 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  26.14 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  26.5 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  26.5 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  27.14 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.95 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  25.93 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  29.25 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  24.04 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  25.53 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  25.9 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  28.04 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>