27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0581 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  838    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  83.67 
 
 
396 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  61.22 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  60.71 
 
 
397 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  61.07 
 
 
397 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  59.65 
 
 
394 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  59.95 
 
 
397 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  26.47 
 
 
354 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  27.53 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  26.78 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  25.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  23.45 
 
 
367 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  23.45 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  23.61 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  25.52 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  24.04 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  21.54 
 
 
343 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  23.05 
 
 
336 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  23.41 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  26.32 
 
 
339 aa  53.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  21.98 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  24.16 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  23.03 
 
 
339 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  24.41 
 
 
338 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  25.44 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  27.45 
 
 
325 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  27.68 
 
 
602 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>