21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3559 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  691    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  35.83 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  31.64 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  30.51 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  30.51 
 
 		 366 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  32.05 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  31.16 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  30.99 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  26.07 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  25.16 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  25.25 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  22.37 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  26.73 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  24.74 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  21.54 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  25.39 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  22 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  21.51 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3260  hypothetical protein  25.71 
 
 		 427 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  26.95 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  26.35 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>