24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3870 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  92.9 
 
 		 338 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  41.34 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  33.98 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  29.73 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  25.87 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  26.63 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  27.52 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  26.22 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  32.07 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  31.38 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  30.41 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  24.05 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  32.56 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  26.63 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  28.97 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  25.12 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  23.16 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  23.68 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  25.47 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  24.44 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  33.9 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  25.23 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  25.5 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>