299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_R0072 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  98.18 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0004  tRNA-Gln  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.39756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0005  tRNA-Gln  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.400107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0003  tRNA-Gln  98 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0094  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300776  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0041  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000496114  hitchhiker  0.0000000000277547 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2529  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2222  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000059382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2233  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2307  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000654744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>