52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1387 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  716    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  33.61 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  35.24 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  35.42 
 
 
367 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  32.46 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  36.62 
 
 
372 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  33.63 
 
 
375 aa  189  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  33.93 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  33.83 
 
 
363 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  32.27 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  31.87 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  32.52 
 
 
361 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  30.4 
 
 
367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  36.36 
 
 
650 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  33.99 
 
 
632 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  36.36 
 
 
632 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  33.93 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  33.63 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  24.56 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  23.48 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  30.71 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  24.66 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  32.35 
 
 
534 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.17 
 
 
691 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  28.63 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  32.73 
 
 
450 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  28.23 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  31.68 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  30.14 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.03 
 
 
651 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.03 
 
 
651 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3199  hypothetical protein  30.13 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  27.86 
 
 
758 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.14 
 
 
763 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  25.83 
 
 
631 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  27.14 
 
 
758 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.37 
 
 
851 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  27.86 
 
 
883 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.14 
 
 
763 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.14 
 
 
763 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.43 
 
 
763 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  29.37 
 
 
638 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.07 
 
 
695 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.43 
 
 
764 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.43 
 
 
764 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.43 
 
 
764 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>