36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0040 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0040  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 166 aa  333  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0423  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.52 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.83 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1773  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.57 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3259  hypothetical protein  27.07 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226697  normal  0.438812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0610  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.33 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0596  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.33 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000617065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0822  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.14 
 
 		 628 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2444  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  19.75 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  30.3 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3644  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  24.81 
 
 		 620 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0646  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.46 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4815  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  22.66 
 
 		 616 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.961579  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5944  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.53 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6903  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.97 
 
 		 625 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4716  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.17 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.60201  normal  0.0226509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0560  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  25.51 
 
 		 625 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.2 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0788  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.95 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.03 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3446  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.22 
 
 		 171 aa  44.3  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.82702  normal  0.0799989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.53 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0760  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.91 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0299127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.92 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2839  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.43 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0112921  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02559  hypothetical protein  24.31 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4816  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  23.19 
 
 		 625 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0034  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  20.59 
 
 		 627 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3006  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  22.6 
 
 		 630 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1646  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.06 
 
 		 186 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.37 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.35 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.1 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003133  TRAP dicarboxylate transporter DctQ subunit  26.23 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00512706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.26 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1549  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component-like  24.27 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>