243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2408 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
946 aa  1883  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.11 
 
 
928 aa  759  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
946 aa  1883  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.17 
 
 
994 aa  736  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.44 
 
 
889 aa  653  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.61 
 
 
929 aa  662  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.61 
 
 
1009 aa  764  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.27 
 
 
926 aa  785  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.67 
 
 
929 aa  771  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.57 
 
 
933 aa  739  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.91 
 
 
994 aa  747  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.34 
 
 
970 aa  739  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.37 
 
 
929 aa  759  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  44.76 
 
 
957 aa  714  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.41 
 
 
949 aa  767  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  86.44 
 
 
937 aa  1549  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.53 
 
 
1001 aa  763  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.93 
 
 
936 aa  1548  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.11 
 
 
951 aa  773  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.73 
 
 
982 aa  768  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.17 
 
 
1009 aa  736  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.29 
 
 
949 aa  739  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
994 aa  748  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.35 
 
 
930 aa  731  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.02 
 
 
934 aa  738  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.81 
 
 
998 aa  734  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
994 aa  748  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
994 aa  747  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
1024 aa  747  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
946 aa  1883  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
994 aa  748  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.38 
 
 
933 aa  765  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.91 
 
 
1088 aa  742  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.41 
 
 
920 aa  786  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.7 
 
 
928 aa  766  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.25 
 
 
923 aa  721  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.23 
 
 
1006 aa  774  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.78 
 
 
918 aa  764  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.18 
 
 
949 aa  739  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.87 
 
 
947 aa  734  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.48 
 
 
1002 aa  764  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  66.02 
 
 
945 aa  1165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
994 aa  748  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.79 
 
 
985 aa  759  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  64.67 
 
 
939 aa  1026  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.71 
 
 
921 aa  1171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.96 
 
 
1085 aa  746  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.33 
 
 
937 aa  813  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.15 
 
 
1009 aa  735  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.81 
 
 
950 aa  749  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.09332e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.81 
 
 
998 aa  734  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.36 
 
 
1004 aa  747  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.64 
 
 
932 aa  710  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.8 
 
 
1030 aa  744  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.97 
 
 
1075 aa  738  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.73 
 
 
1008 aa  733  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.68 
 
 
936 aa  774  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.53 
 
 
884 aa  616  1e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.99 
 
 
952 aa  613  1e-174  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.03 
 
 
938 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.61 
 
 
933 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 
931 aa  577  1e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.02 
 
 
929 aa  577  1e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.78 
 
 
929 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.23 
 
 
931 aa  559  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.12 
 
 
906 aa  555  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
929 aa  555  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
929 aa  555  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  1.74255e-10 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 
957 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.99 
 
 
940 aa  550  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.8 
 
 
929 aa  549  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 
938 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.06 
 
 
905 aa  525  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.78 
 
 
939 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.63 
 
 
947 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.57 
 
 
938 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 
946 aa  509  1e-142  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.29 
 
 
932 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.25 
 
 
972 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.26 
 
 
937 aa  499  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.08 
 
 
954 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38 
 
 
914 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.9 
 
 
954 aa  494  1e-138  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.83 
 
 
1018 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 
945 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.93 
 
 
882 aa  492  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.31 
 
 
928 aa  489  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.5 
 
 
892 aa  485  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 
926 aa  485  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.91 
 
 
883 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 
881 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 
898 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.51 
 
 
940 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 
879 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.5 
 
 
878 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.92 
 
 
878 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 
879 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.92 
 
 
878 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 
1021 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
887 aa  470  1e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>