30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2351 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  29.58 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  33.6 
 
 		 273 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  26.14 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  24.65 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  24.83 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  27.46 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  26.15 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  24.16 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  24.48 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  31.13 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  25.17 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0343  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  23.84 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0637  FixH family protein  21.77 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  20.69 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  27.12 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  20 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  26.76 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  20 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  20.69 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  20.69 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  20.69 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  24.22 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  20 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  19.31 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  19.31 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  19.31 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  21.83 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>