More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0357 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0357  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  95.82 
 
 
239 aa  468  1e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0480  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  89.12 
 
 
239 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.116594  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  76.99 
 
 
237 aa  380  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  50.83 
 
 
247 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.61 
 
 
245 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.48 
 
 
256 aa  221  6e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  44.96 
 
 
236 aa  220  2e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.92 
 
 
244 aa  216  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.41 
 
 
258 aa  211  6e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.56 
 
 
231 aa  211  6e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.56 
 
 
270 aa  205  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.44 
 
 
249 aa  201  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.3 
 
 
257 aa  201  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.21 
 
 
258 aa  200  1e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 
252 aa  200  2e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  44.92 
 
 
252 aa  199  2e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.17 
 
 
280 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  39.92 
 
 
252 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.52 
 
 
247 aa  195  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
252 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.28 
 
 
270 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  41.08 
 
 
248 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.93391e-11  hitchhiker  5.36113e-07 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  38.84 
 
 
245 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.74 
 
 
270 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.10136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  43.39 
 
 
377 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  40.16 
 
 
264 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.08 
 
 
278 aa  191  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.45 
 
 
274 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.04 
 
 
251 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.56 
 
 
273 aa  189  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.67 
 
 
266 aa  189  3e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.41 
 
 
253 aa  189  3e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  38.78 
 
 
269 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.7 
 
 
250 aa  188  6e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  40.91 
 
 
269 aa  188  6e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 
250 aa  188  6e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.3 
 
 
248 aa  188  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0544  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.12 
 
 
246 aa  188  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  3.53659e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 
250 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.08 
 
 
480 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.5 
 
 
388 aa  186  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.6 
 
 
256 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.66 
 
 
395 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.91 
 
 
383 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.32 
 
 
383 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  42.86 
 
 
257 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 
270 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.75 
 
 
270 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.16 
 
 
377 aa  185  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  39.24 
 
 
248 aa  185  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.16 
 
 
244 aa  184  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.6 
 
 
244 aa  184  1e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.56 
 
 
287 aa  184  1e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  42.08 
 
 
257 aa  183  2e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  43.93 
 
 
260 aa  183  2e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.82 
 
 
272 aa  183  2e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.66 
 
 
247 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2539  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.21 
 
 
270 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.214496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.22 
 
 
271 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00151829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.48 
 
 
271 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.48 
 
 
250 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.48 
 
 
250 aa  181  8e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
266 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.51 
 
 
251 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  38.62 
 
 
349 aa  179  3e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.44 
 
 
256 aa  179  3e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4143  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40 
 
 
273 aa  179  3e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.417024  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.18 
 
 
254 aa  179  3e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.31 
 
 
347 aa  179  3e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.18 
 
 
254 aa  179  3e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.93 
 
 
243 aa  179  3e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.57 
 
 
247 aa  179  3e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
348 aa  179  3e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.33 
 
 
364 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
266 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.42 
 
 
249 aa  178  6e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.18 
 
 
396 aa  178  6e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.04 
 
 
250 aa  178  6e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.31 
 
 
379 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4109  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
269 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  37.04 
 
 
253 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.21 
 
 
266 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.66 
 
 
259 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.24 
 
 
387 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.75 
 
 
389 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 
403 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3938  MoeZ/MoeB  40.93 
 
 
267 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0267077 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.9 
 
 
386 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.84 
 
 
243 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.25 
 
 
386 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.76 
 
 
249 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.67 
 
 
383 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>