29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0038 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  100 
 
 
151 aa  294  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  100 
 
 
151 aa  294  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  96.69 
 
 
151 aa  287  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  78.15 
 
 
151 aa  248  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  52.47 
 
 
166 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  36.3 
 
 
349 aa  74.7  4e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.01698e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  34.65 
 
 
368 aa  63.5  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  32.33 
 
 
361 aa  62.4  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  34.65 
 
 
356 aa  62.4  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  30.6 
 
 
381 aa  62  3e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  35.43 
 
 
360 aa  61.2  5e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  31.58 
 
 
363 aa  60.5  7e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  30.77 
 
 
369 aa  60.5  7e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  30.34 
 
 
354 aa  60.1  1e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  33.87 
 
 
337 aa  59.7  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  33.09 
 
 
367 aa  58.5  3e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  29.85 
 
 
365 aa  58.2  4e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  34.06 
 
 
362 aa  56.6  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  32.54 
 
 
353 aa  54.7  4e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.53988e-12  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  39.62 
 
 
361 aa  53.5  1e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  30.22 
 
 
364 aa  51.6  4e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  51.2  5e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  30.43 
 
 
366 aa  50.8  6e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  30.65 
 
 
356 aa  47.4  7e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  30.66 
 
 
354 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  27.83 
 
 
345 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  28.89 
 
 
352 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  28.32 
 
 
352 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  28.7 
 
 
353 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>