57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00590 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00590  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  203  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4025  hypothetical protein  42.31 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874833  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6430  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3588  putative transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0192393  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4436  regulatory protein MerR  40.59 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.465157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2788  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  37.66 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1572  hypothetical protein  41.25 
 
 
104 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  38.16 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  36.84 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  35.53 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
161 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  34.07 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  30.23 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2006  hypothetical protein  36.23 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0151829  normal  0.258425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  36.9 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  35.9 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0568  hypothetical protein  30.23 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0186842 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  28 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  30.77 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  42.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  35.62 
 
 
118 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 
152 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
243 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  32.76 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  32.76 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1857  hypothetical protein  26.44 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000070649  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0133  hypothetical protein  41.1 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0579  hypothetical protein  32.35 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>