23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0035 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    93.33 
 
 		 203 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>