47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0310 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  81.54 
 
 
230 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  65.75 
 
 
217 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  65.75 
 
 
217 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  65.75 
 
 
217 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  59.91 
 
 
218 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  40.61 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  31.15 
 
 
530 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.7 
 
 
314 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  28.73 
 
 
454 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  34.39 
 
 
295 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  31.53 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  33.53 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  32.99 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  31.55 
 
 
503 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  25.53 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  30.3 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  27.87 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  30.65 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  37.37 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  26.34 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  28.96 
 
 
278 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  28.33 
 
 
313 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  33.54 
 
 
168 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  24.61 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  29.44 
 
 
695 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  30.17 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  31.51 
 
 
780 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  29.86 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  26.79 
 
 
189 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  31.13 
 
 
167 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  28.48 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  27.91 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  27.06 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.66 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  24.4 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  28.66 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  30.06 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  26.88 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  26.63 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  30.87 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  25.61 
 
 
173 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  26.58 
 
 
164 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.66 
 
 
177 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  26.58 
 
 
164 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  27.01 
 
 
199 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>