64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3678 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.35 
 
 
314 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  40.66 
 
 
230 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  37.14 
 
 
217 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  37.14 
 
 
217 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  40.51 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  40.61 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  28.7 
 
 
454 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.64 
 
 
216 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  32.24 
 
 
530 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  31.16 
 
 
503 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  31.47 
 
 
503 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  31.72 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  28.51 
 
 
358 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  33.52 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  31.44 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  21.61 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  27.32 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  29.17 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  29.15 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  28.02 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  31.45 
 
 
168 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  29.35 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  31.68 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  31.98 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  28.36 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  29.8 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  31.17 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  29.48 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  29.19 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.72 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  33.33 
 
 
108 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  32.67 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.85 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  32.88 
 
 
164 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  31.85 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  32.41 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  31.03 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  31.69 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  32.45 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  32.34 
 
 
164 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  32.34 
 
 
164 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  32.28 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  31.47 
 
 
167 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  31.72 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  28.99 
 
 
181 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  32.21 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  29.93 
 
 
170 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  48.9  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  28.97 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  30.77 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  34.78 
 
 
185 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  29.61 
 
 
220 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  30.89 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  29.8 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  33.9 
 
 
695 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  29.17 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>