27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4196 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  42.78 
 
 		 313 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  31.96 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  28.32 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  28.36 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.27 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  27.93 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  24.61 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  27.53 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  27.53 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  23.61 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  32.48 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  26.09 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  31.53 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  31.58 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  29.84 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  22.77 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  27.59 
 
 		 189 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  50 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  29.89 
 
 		 503 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  28.83 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  24.55 
 
 		 503 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>