23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0935 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  52.84 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  43.52 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  31.9 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  27.37 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.38 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  28.71 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  27.87 
 
 		 454 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.51 
 
 		 530 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  28.96 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  25.99 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  25.99 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  25.86 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  25.12 
 
 		 503 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  25.53 
 
 		 503 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  25.24 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  23.7 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  28.3 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>