33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3353 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1009    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  68.64 
 
 
531 aa  692    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 
687 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  35.75 
 
 
469 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  33.27 
 
 
676 aa  259  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  31.73 
 
 
686 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  34.8 
 
 
678 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  33.95 
 
 
679 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  33.26 
 
 
684 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  38.32 
 
 
470 aa  251  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  36.14 
 
 
676 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  36.84 
 
 
676 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  33.02 
 
 
694 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  36.3 
 
 
684 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  35.1 
 
 
477 aa  242  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 
679 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  35.39 
 
 
681 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  34.79 
 
 
682 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  33.94 
 
 
682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  33.89 
 
 
670 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  31.5 
 
 
686 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  34.17 
 
 
682 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  33.41 
 
 
694 aa  227  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  33.33 
 
 
681 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  31.65 
 
 
689 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  32.24 
 
 
675 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  31.02 
 
 
678 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  31.8 
 
 
703 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  35.09 
 
 
473 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  31.22 
 
 
485 aa  170  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  29.02 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
186 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  42.53 
 
 
1838 aa  67  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>