More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5701 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  100 
 
 
467 aa  938    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  47.31 
 
 
441 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  45.75 
 
 
438 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  46.54 
 
 
441 aa  348  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  46.31 
 
 
441 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  47.07 
 
 
441 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  45.29 
 
 
448 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  45.5 
 
 
441 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  45.43 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  45.01 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  44.96 
 
 
442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  44.18 
 
 
430 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  44.68 
 
 
442 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  43.15 
 
 
442 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  46.06 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  47.54 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  42.92 
 
 
442 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  44.42 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  45 
 
 
447 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  43.62 
 
 
440 aa  316  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  41.4 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  43.02 
 
 
470 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  45.39 
 
 
447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  44.76 
 
 
447 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  42.62 
 
 
442 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  43.12 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  42.39 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  45.22 
 
 
432 aa  299  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  45.05 
 
 
435 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  44.34 
 
 
422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  40.68 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  44.15 
 
 
412 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  43.16 
 
 
424 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  43.69 
 
 
437 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  37.86 
 
 
435 aa  264  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  40.94 
 
 
423 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  45.21 
 
 
424 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  37.38 
 
 
434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  45.26 
 
 
422 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  40.4 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  34.87 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  42.08 
 
 
437 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.38 
 
 
442 aa  247  4e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 
426 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  35.56 
 
 
435 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  36.76 
 
 
443 aa  210  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.62 
 
 
434 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 
427 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.94 
 
 
420 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  36.85 
 
 
412 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  37.11 
 
 
437 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.32 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.99 
 
 
428 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.65 
 
 
443 aa  193  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  32.73 
 
 
425 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  38.24 
 
 
425 aa  192  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  35.71 
 
 
416 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 
418 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32.24 
 
 
418 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  39.61 
 
 
437 aa  186  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
441 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  34.93 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  36.01 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.14 
 
 
422 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
441 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  33.79 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  37.56 
 
 
437 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  34.16 
 
 
432 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
425 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.75 
 
 
427 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  34.17 
 
 
436 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.03 
 
 
421 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  36.44 
 
 
432 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  36.36 
 
 
425 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
429 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  37.9 
 
 
448 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  34.09 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  35.77 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.44 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  33.91 
 
 
433 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.78 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.13 
 
 
466 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  33.12 
 
 
440 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  32.88 
 
 
416 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  36.23 
 
 
432 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.09 
 
 
422 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  32.88 
 
 
416 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  35.33 
 
 
437 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.54 
 
 
437 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.54 
 
 
435 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 
435 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  35.46 
 
 
433 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.81 
 
 
431 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>