More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0987 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  55.95 
 
 
418 aa  278  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  50.41 
 
 
409 aa  261  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  9.791e-05  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
268 aa  261  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  44.53 
 
 
418 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
266 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.4 
 
 
424 aa  229  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  45.14 
 
 
266 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  44.75 
 
 
266 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  42.91 
 
 
267 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
536 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  45.04 
 
 
261 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  45.04 
 
 
261 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  45.04 
 
 
261 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
265 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
262 aa  213  2e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  43.03 
 
 
424 aa  212  4e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  40.39 
 
 
455 aa  212  5e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
264 aa  212  6e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  44.26 
 
 
260 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.57 
 
 
490 aa  211  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.54 
 
 
490 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  42.69 
 
 
259 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.13 
 
 
414 aa  209  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.04 
 
 
253 aa  207  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 
255 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  44.44 
 
 
257 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  42.32 
 
 
262 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  38.76 
 
 
258 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  42.11 
 
 
255 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.4 
 
 
257 aa  205  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.08 
 
 
255 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
255 aa  204  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
255 aa  204  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.08 
 
 
255 aa  204  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  41.9 
 
 
261 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  41.67 
 
 
267 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 
255 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
264 aa  201  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
251 aa  201  1e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  2.97439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
265 aa  201  1e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  42.63 
 
 
259 aa  200  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.49 
 
 
266 aa  200  2e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  42.19 
 
 
264 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.96 
 
 
269 aa  199  4e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
266 aa  199  4e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  43.93 
 
 
280 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
255 aa  198  8e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  41.43 
 
 
259 aa  197  1e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  40.65 
 
 
405 aa  197  2e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  40.24 
 
 
255 aa  196  2e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  44.08 
 
 
267 aa  197  2e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  43.46 
 
 
257 aa  197  2e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.11 
 
 
258 aa  197  2e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
279 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  40.66 
 
 
253 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.3 
 
 
254 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  41.83 
 
 
419 aa  195  8e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.02 
 
 
285 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
260 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  39.04 
 
 
271 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
271 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
271 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.61 
 
 
625 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  39.04 
 
 
271 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  42.55 
 
 
262 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
271 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
271 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
271 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
271 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3140  ABC transporter related  42.75 
 
 
269 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364263  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  40.4 
 
 
262 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
271 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  40.89 
 
 
285 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
293 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  37.75 
 
 
273 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
256 aa  193  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.96 
 
 
271 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  38.55 
 
 
277 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  38.06 
 
 
255 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  41.25 
 
 
287 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  42.74 
 
 
264 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  38.28 
 
 
254 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  44.2 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  40.4 
 
 
263 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 
267 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  40.64 
 
 
258 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  38.96 
 
 
297 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  38.96 
 
 
297 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  40.64 
 
 
278 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  40.6 
 
 
253 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
278 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  38.96 
 
 
297 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
265 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
263 aa  189  3e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
265 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.54 
 
 
268 aa  189  3e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
265 aa  189  3e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
262 aa  189  3e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  42.02 
 
 
259 aa  189  3e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>