28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3528 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  610  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  54.34 
 
 		 314 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  46.62 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  29.87 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  29.19 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  27.33 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  27.56 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  23.84 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  22.82 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  23.61 
 
 		 331 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  23.66 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  23.66 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  24.07 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  23 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  22.18 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  25.47 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  22.73 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  23.05 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  23.29 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  23.4 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  27.24 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  22.26 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  22.97 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  26.34 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  21.97 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  26.26 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.918857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  23.26 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  32.98 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>