More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0004 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 491 aa  1011    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  68.04 
 
 		 491 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  53.4 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 		 474 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  49.04 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  50 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  48.03 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  48.39 
 
 		 487 aa  455  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  47.55 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  45.57 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  48.31 
 
 		 494 aa  435  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  46.26 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  46.56 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  44.99 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  44.62 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  44.62 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  44.62 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 		 463 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  44.18 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  43.15 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1504  argininosuccinate lyase  44.15 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  42.46 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  43.51 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  43.86 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  44.97 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  41.58 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  43.76 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  44.16 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  42.66 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  43.05 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 459 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  42.01 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  41.52 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  40.77 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  42.32 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  43.18 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  42.35 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 461 aa  352  8e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  40.76 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  41.15 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  40.76 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  40.35 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  42.35 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  42.8 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  40.08 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 		 459 aa  350  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  43.83 
 
 		 459 aa  350  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  41.54 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  42.42 
 
 		 464 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  41.45 
 
 		 476 aa  349  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 		 464 aa  349  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  42.04 
 
 		 464 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  42.29 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  41.61 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  42.17 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  41.94 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 		 464 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  41.48 
 
 		 486 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  41.48 
 
 		 486 aa  345  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  41.93 
 
 		 458 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  42.26 
 
 		 464 aa  345  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  41.67 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  41.78 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  40.87 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  41.05 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  41.83 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  43.56 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  40.77 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  42.28 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  40.34 
 
 		 469 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  42.28 
 
 		 499 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  42.53 
 
 		 471 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  44.94 
 
 		 491 aa  343  5.999999999999999e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  43.02 
 
 		 469 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  41.87 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  42.14 
 
 		 493 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  40.74 
 
 		 457 aa  342  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5512  argininosuccinate lyase  44.37 
 
 		 462 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  40 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  41.65 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  41.63 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  40.88 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  46.35 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  46.35 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>