More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2031 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  100 
 
 
95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 
96 aa  153  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 
96 aa  153  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
96 aa  150  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 
97 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  74.74 
 
 
96 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  76.04 
 
 
97 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
97 aa  146  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  73.96 
 
 
97 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  72.92 
 
 
96 aa  143  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 
96 aa  137  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
96 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 
96 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 
96 aa  133  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
105 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  63.16 
 
 
96 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
105 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
105 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  65.26 
 
 
105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  65.26 
 
 
105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
96 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
96 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
105 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  58.95 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  58.95 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  58.95 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03919  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  124  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
96 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
96 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  56.84 
 
 
105 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  56.84 
 
 
105 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  56.84 
 
 
105 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  56.84 
 
 
105 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  123  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 
98 aa  123  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
96 aa  123  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0956  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
95 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
96 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
104 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
104 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  60 
 
 
96 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
104 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
96 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  60 
 
 
96 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3752  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 
96 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.872968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  60 
 
 
96 aa  120  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0843  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  63.54 
 
 
96 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200224  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
95 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
97 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
96 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
96 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
96 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3823  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  60 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>