27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1150 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  59.02 
 
 		 185 aa  240  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  58.47 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  59.34 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  57.92 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.59 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  34.81 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.59 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.55 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  37.32 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.33 
 
 		 167 aa  98.2  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.12 
 
 		 178 aa  97.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.35 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  35.71 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.91 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.48 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.52 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.24 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.17 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  30.37 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  26.81 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  28.19 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.54 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.81 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.2 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.98 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  25 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>