70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0789 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  46.51 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  54 
 
 		 176 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  47.77 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  49.66 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  47.44 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  48.03 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  46.71 
 
 		 177 aa  151  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  45.81 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  44.64 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  45.81 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  48.47 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  42.21 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  42 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  40.48 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  42 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  40.67 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  40.67 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  41.72 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  41.18 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  40.67 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  35.58 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  37.22 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  35.29 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  43.24 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  35.58 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  35.54 
 
 		 177 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  37.91 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  37.18 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  36.18 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  35.15 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  33.78 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  26.9 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  33.1 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  26.9 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  31.39 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  30.37 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  26.62 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  30.99 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  30.07 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.17 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  28.92 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  26.39 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  26.39 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  28.99 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  32.08 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  29.84 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.32 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  29.5 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  22.82 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  25.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.4 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  25.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  27.86 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  30.28 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  28.97 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2620  hypothetical protein  29.36 
 
 		 130 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  24.34 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  28.95 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>