55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01157 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  814    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  40.35 
 
 
409 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  36.88 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  33.42 
 
 
409 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  35.38 
 
 
461 aa  259  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  31.71 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  36.17 
 
 
355 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  32.14 
 
 
392 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  30.28 
 
 
443 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  30.39 
 
 
427 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  31.67 
 
 
467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  29.74 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  29.98 
 
 
444 aa  220  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  36.68 
 
 
454 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  32.34 
 
 
551 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  28.28 
 
 
208 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  28.73 
 
 
198 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  29.8 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  27.14 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  28.43 
 
 
201 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  26.47 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  26.84 
 
 
197 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  24.18 
 
 
199 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  27.82 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  35.82 
 
 
204 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  32.69 
 
 
532 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  26.29 
 
 
378 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  27.32 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  29.41 
 
 
499 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  26.42 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4067  protein of unknown function DUF445  30.53 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0033  hypothetical protein  40 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.374714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0408  protein of unknown function DUF445  25.66 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  28.68 
 
 
499 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  27.27 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000648113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0398  protein of unknown function DUF445  25.66 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0915  hypothetical protein  26.29 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  24.35 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000215951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  26.26 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  26.26 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  23.62 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4423  hypothetical protein  26.8 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000169589  normal  0.358776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3973  hypothetical protein  24.62 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  30.3 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  38.67 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  26.38 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000116192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0748  protein of unknown function DUF445  28.57 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5881  hypothetical protein  20.1 
 
 
186 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  25.77 
 
 
378 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1382  hypothetical protein  28.12 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000601426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  23.94 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0899  hypothetical protein  24.85 
 
 
537 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.860186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0694  hypothetical protein  27.14 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>