31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2608 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  848    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  39.4 
 
 
409 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  32.82 
 
 
454 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  31.97 
 
 
402 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  30.82 
 
 
461 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  30.13 
 
 
409 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  31.77 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  27.7 
 
 
355 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  27.56 
 
 
392 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  27.82 
 
 
467 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  25.67 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  23.74 
 
 
443 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  25.06 
 
 
444 aa  155  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  25.06 
 
 
444 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  25.81 
 
 
551 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  25.38 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  26.13 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  24.08 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  26.52 
 
 
198 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  26.5 
 
 
201 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  23.98 
 
 
199 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  20.9 
 
 
202 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  24.77 
 
 
201 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  22.14 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  22.14 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  36.51 
 
 
411 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  26.79 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  28.17 
 
 
204 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  34.62 
 
 
512 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  28 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>