26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0801 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  78.08 
 
 
444 aa  704    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  905    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  76.94 
 
 
444 aa  691    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  35.78 
 
 
409 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  33.74 
 
 
392 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  30.28 
 
 
402 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  31.79 
 
 
461 aa  223  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  26.38 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  29.28 
 
 
467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  25.24 
 
 
409 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  24.57 
 
 
454 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  27.71 
 
 
355 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  28.27 
 
 
403 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  23.63 
 
 
420 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  28.67 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  25.48 
 
 
208 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  22.6 
 
 
202 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  21.29 
 
 
201 aa  60.1  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  22.71 
 
 
197 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  23.74 
 
 
198 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  23.7 
 
 
199 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  22.01 
 
 
200 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  22.82 
 
 
198 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  22.01 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  27.1 
 
 
532 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  24.68 
 
 
512 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>