31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35977 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  100 
 
 
551 aa  1129    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  44.69 
 
 
467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  35.37 
 
 
355 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  32.19 
 
 
409 aa  206  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  32.3 
 
 
461 aa  206  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  32.34 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  33.51 
 
 
403 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  29.16 
 
 
409 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  28.62 
 
 
454 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  28.78 
 
 
392 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  28.67 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  29.53 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  25.94 
 
 
420 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  27.45 
 
 
427 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  28.86 
 
 
444 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  26.54 
 
 
197 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  23.39 
 
 
201 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  23.12 
 
 
198 aa  60.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  22.89 
 
 
202 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  23.89 
 
 
201 aa  57  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  21.4 
 
 
200 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  29.41 
 
 
204 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  23.72 
 
 
208 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  21.39 
 
 
198 aa  50.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  24.76 
 
 
199 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  35.53 
 
 
532 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  30.34 
 
 
512 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0748  protein of unknown function DUF445  23.68 
 
 
413 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5881  hypothetical protein  21.9 
 
 
186 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  30.97 
 
 
378 aa  43.9  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  43.9  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>