40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1953 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  810    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  37.06 
 
 
402 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  36.88 
 
 
409 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  37.47 
 
 
461 aa  256  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  34.44 
 
 
409 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  31.71 
 
 
420 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  33.42 
 
 
467 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  33.63 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  33.33 
 
 
551 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  29.15 
 
 
392 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  32.86 
 
 
454 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  29.13 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  27.33 
 
 
444 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  28.24 
 
 
444 aa  180  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  27.46 
 
 
427 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  26.98 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  27.36 
 
 
200 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  27.36 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  26.63 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  22.7 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  26.94 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  23.2 
 
 
201 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  25.48 
 
 
208 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  21.88 
 
 
201 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  30.65 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000648113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  30.65 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  30.89 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  30.65 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000276584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  30.65 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  32.46 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000116192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0915  hypothetical protein  30.08 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  30.69 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  33.33 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  30.4 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000215951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  21.13 
 
 
204 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1026  hypothetical protein  25.87 
 
 
1271 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  0.0000000000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4423  hypothetical protein  29.27 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000169589  normal  0.358776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1432  protein of unknown function DUF445  37.68 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  35.82 
 
 
411 aa  43.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4067  protein of unknown function DUF445  35.38 
 
 
406 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>