26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1744 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  904    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  97.97 
 
 
444 aa  886    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  78.08 
 
 
443 aa  704    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  34.1 
 
 
409 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  32.38 
 
 
392 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  29.74 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  30.09 
 
 
461 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  26.38 
 
 
427 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  28.7 
 
 
467 aa  193  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  26.12 
 
 
409 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  27.02 
 
 
355 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  27.58 
 
 
403 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  25.85 
 
 
454 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  25.24 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  29.53 
 
 
551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  27.27 
 
 
198 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  22.97 
 
 
208 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  24.42 
 
 
202 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  21.26 
 
 
201 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  23.04 
 
 
197 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  24.89 
 
 
198 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  23.47 
 
 
201 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  25.32 
 
 
512 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  24.77 
 
 
199 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  17.54 
 
 
200 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  28.57 
 
 
532 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>