59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1369 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  48.44 
 
 
198 aa  198  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  33.98 
 
 
200 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  36.87 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  28.95 
 
 
198 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5881  hypothetical protein  29.19 
 
 
186 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  29.89 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  26.87 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  28.21 
 
 
454 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  29.8 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  31.69 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  26.21 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  25.39 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  27.15 
 
 
499 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  28.77 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0899  hypothetical protein  31.78 
 
 
537 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.860186  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  23.12 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  23.85 
 
 
467 aa  67  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1432  protein of unknown function DUF445  36.27 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  23.44 
 
 
403 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  31.3 
 
 
512 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  26.5 
 
 
420 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  21.8 
 
 
355 aa  62  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1382  hypothetical protein  29.27 
 
 
376 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000601426  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  39.13 
 
 
411 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  21.29 
 
 
443 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  21.26 
 
 
444 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  24.08 
 
 
392 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0694  hypothetical protein  28.26 
 
 
378 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134736  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  21.26 
 
 
444 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  23.89 
 
 
551 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  36.23 
 
 
411 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  40 
 
 
374 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  40 
 
 
374 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  22.17 
 
 
427 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  30.71 
 
 
378 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  32 
 
 
412 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  32.61 
 
 
381 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  39.19 
 
 
378 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  34.21 
 
 
364 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  32.61 
 
 
381 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000215951  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0748  protein of unknown function DUF445  38.46 
 
 
413 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  27.86 
 
 
381 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000648113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  27.86 
 
 
381 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  27.86 
 
 
378 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4423  hypothetical protein  32 
 
 
378 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000169589  normal  0.358776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0915  hypothetical protein  39.19 
 
 
381 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  27.94 
 
 
372 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000116192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3973  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0033  hypothetical protein  21.88 
 
 
370 aa  48.5  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.374714  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0398  protein of unknown function DUF445  36.92 
 
 
417 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0408  protein of unknown function DUF445  36.92 
 
 
417 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1026  hypothetical protein  32.89 
 
 
1271 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  0.0000000000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4067  protein of unknown function DUF445  33.8 
 
 
406 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2347  protein of unknown function DUF445  27.84 
 
 
422 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  21.78 
 
 
232 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000381321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>