50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  39.4 
 
 		 420 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  37 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  33.42 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  34.52 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  32.93 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  34.39 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  34.05 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  28.75 
 
 		 467 aa  196  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  28.17 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  25.24 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  26.12 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  29.16 
 
 		 551 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  27.38 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  25.65 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  34.17 
 
 		 202 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  26.8 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  32.83 
 
 		 208 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  25.39 
 
 		 201 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  29.5 
 
 		 198 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  22.22 
 
 		 199 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  23.66 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  24.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  27.06 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5881  hypothetical protein  18.56 
 
 		 186 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  0.487287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  25.9 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  26.5 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4067  protein of unknown function DUF445  38.38 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  25.48 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0899  hypothetical protein  31.58 
 
 		 537 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.860186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  43.28 
 
 		 378 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0408  protein of unknown function DUF445  28.29 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0694  hypothetical protein  38.96 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0398  protein of unknown function DUF445  28.29 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  46.67 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4423  hypothetical protein  43.28 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000169589  normal  0.358776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0915  hypothetical protein  43.28 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  46.67 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  32.32 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  45 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  45 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000648113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  45 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000215951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  45 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  29.03 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  45 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000116192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  32.43 
 
 		 512 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  32.63 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0033  hypothetical protein  33.77 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.374714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1382  hypothetical protein  32.65 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000601426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>