39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0033 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0033  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  709    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.374714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  44.35 
 
 
364 aa  269  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0952  hypothetical protein  24.12 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000215951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0767  hypothetical protein  24.39 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.07523e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1382  hypothetical protein  24.54 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000601426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0760  hypothetical protein  24.12 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0766  hypothetical protein  24.19 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.640057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0915  hypothetical protein  23.28 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1042  hypothetical protein  23.85 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0954  hypothetical protein  23.42 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0862  hypothetical protein  23.42 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000116192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0819  hypothetical protein  23.42 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000648113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4423  hypothetical protein  23.47 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000169589  normal  0.358776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0694  hypothetical protein  20.48 
 
 
378 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  23.48 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  23.48 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  29.55 
 
 
199 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1432  protein of unknown function DUF445  19.84 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  32.32 
 
 
204 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  26.88 
 
 
201 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  41.82 
 
 
197 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  23.03 
 
 
200 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  40 
 
 
402 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1421  hypothetical protein  20.86 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  38.96 
 
 
499 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  38.96 
 
 
499 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4319  hypothetical protein  22.28 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0741312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  21.88 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1098  hypothetical protein  29.59 
 
 
412 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288436  normal  0.0465227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1309  hypothetical protein  26.46 
 
 
512 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000251164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  35.38 
 
 
198 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  32.5 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  30.43 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  31.88 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  34.48 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3973  hypothetical protein  30.88 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  33.77 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0748  protein of unknown function DUF445  30.49 
 
 
413 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>