15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00064 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  40.92 
 
 
393 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  38.52 
 
 
430 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  31.47 
 
 
383 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  28.57 
 
 
390 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  29.02 
 
 
393 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  29.38 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  27.59 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  28.53 
 
 
402 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  27.23 
 
 
384 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  26.03 
 
 
403 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  22.14 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  22.41 
 
 
421 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  23.95 
 
 
411 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  25.63 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>