179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2173 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  286  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  89.78 
 
 		 137 aa  261  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  82.35 
 
 		 140 aa  239  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  82.35 
 
 		 140 aa  239  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  82.35 
 
 		 139 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  78.83 
 
 		 138 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  72.99 
 
 		 139 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  71.11 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  63.5 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  63.5 
 
 		 137 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  62.04 
 
 		 137 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  59.85 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  59.85 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  62.77 
 
 		 137 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  58.39 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  62.04 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  62.04 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  57.66 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  57.66 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  58.09 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  56.2 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  55.47 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  55.47 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  55.47 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  56.52 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  54.74 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  55.07 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  55.07 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  56.2 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  52.55 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  56.2 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  55.8 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  53.28 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  53.33 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  56.93 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  55.88 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  43.38 
 
 		 135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  48.51 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  45.86 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  44.03 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  46.67 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  48.15 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  48.51 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  49.62 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  43.28 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  45.75 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  44.81 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  41.61 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  40.67 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  43.51 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  43.07 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  43.7 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  45.31 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  42.76 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  43.75 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  43.71 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  42.96 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  40.28 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  41.18 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  44 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  41.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  40.79 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  39.22 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  42.65 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  39.19 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  37.91 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  34.44 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  38.82 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  37.09 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  33.77 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  39.19 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  37.09 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  35.53 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  38.93 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  38.51 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  36.92 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  37.16 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0496  protein of unknown function DUF55  36.57 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  36.42 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  38.67 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  38.67 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  37.33 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  38.67 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  35.37 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  35.71 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  35.14 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>