More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1170 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  42.26 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  41.13 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  40.17 
 
 
250 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  40.17 
 
 
250 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  40.17 
 
 
250 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  39.75 
 
 
250 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  39.75 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  39.75 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  39.75 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  39.75 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
250 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  38.91 
 
 
250 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  38.91 
 
 
250 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  39.75 
 
 
250 aa  178  8e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  40.16 
 
 
258 aa  175  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  41.06 
 
 
245 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1512  Serine/threonine protein phosphatase  33.19 
 
 
244 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0788  Serine/threonine protein phosphatase  36.4 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  42.44 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  36.51 
 
 
241 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  35.15 
 
 
247 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  35.15 
 
 
247 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  37.39 
 
 
421 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.56 
 
 
236 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  35.2 
 
 
254 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.71 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
257 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.1 
 
 
247 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
415 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.26 
 
 
271 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.89 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  36.91 
 
 
416 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 
266 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  35.54 
 
 
449 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
395 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  34.4 
 
 
256 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  34.04 
 
 
239 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.1 
 
 
261 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
256 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
256 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
253 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.89 
 
 
463 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  33.2 
 
 
419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3469  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 
421 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171174  normal  0.272032 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
470 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.26 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  34.45 
 
 
469 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  36.75 
 
 
425 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 
540 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.41 
 
 
313 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 
319 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  35.27 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  34.44 
 
 
466 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  32.51 
 
 
236 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
236 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  37.66 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.8 
 
 
386 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.64 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  33.61 
 
 
348 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 
479 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  33.76 
 
 
452 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 
426 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
467 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.35 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  31.38 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32.08 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  33.6 
 
 
507 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.44 
 
 
554 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
320 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  34.17 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 
394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  35.56 
 
 
474 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 
519 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
280 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 
472 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  34.75 
 
 
505 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3279  protein serine/threonine phosphatase  34.73 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0342003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 
264 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  32.93 
 
 
276 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.02 
 
 
239 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  34.65 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  33.75 
 
 
441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
449 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
239 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  32.65 
 
 
255 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.65 
 
 
251 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 
293 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  33.61 
 
 
564 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.8 
 
 
597 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.61 
 
 
241 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>