More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1584 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  73.68 
 
 		 79 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  77.03 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  77.03 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  72.37 
 
 		 80 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  72.97 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  72.37 
 
 		 82 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  72.97 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  72.37 
 
 		 81 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  72.97 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  74.32 
 
 		 78 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  72.97 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  72.97 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  72.97 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  72.97 
 
 		 78 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  74.32 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  72.97 
 
 		 79 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  62.03 
 
 		 82 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  62.03 
 
 		 82 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  66.23 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  61.73 
 
 		 82 aa  106  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  64.56 
 
 		 81 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  64.86 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  61.84 
 
 		 80 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  53.75 
 
 		 82 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  53.25 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  57.89 
 
 		 80 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  59.74 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  53.95 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  53.95 
 
 		 80 aa  87  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  50.67 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  52 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  53.33 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  52.86 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  56.16 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  56.16 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  45.12 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  43.04 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  42.68 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  41.77 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  39.02 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  39.02 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  39.02 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  39.02 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  39.02 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  41.38 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  42.86 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.1 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  41.1 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  43.82 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  41.1 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  41.1 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  41.1 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  38.89 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  42.68 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  40.24 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  41.67 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  47.89 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  40.23 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  40.23 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  42.86 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  39.19 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  44.87 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  39.08 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  41.46 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  45.83 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  47.3 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  44.93 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  37.84 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  41.67 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  41.89 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  41.79 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  41.89 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  60.87 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  49.28 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  41.98 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  41.67 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  38.03 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  41.33 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  38.96 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  51.02 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  38.89 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  38.89 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  38.89 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  37.5 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  41.18 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  48.33 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  37.5 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  36.36 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>