More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1572 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
266 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  83.93 
 
 
247 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.39 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.2 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.7 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.7 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.88 
 
 
253 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.98 
 
 
238 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  44.16 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.42 
 
 
242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.37 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.37 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.64 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
239 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.42 
 
 
242 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.42 
 
 
242 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.15 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.42 
 
 
242 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.42 
 
 
242 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 
242 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.42 
 
 
242 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
238 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.91 
 
 
240 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.42 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.42 
 
 
242 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.89 
 
 
233 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.36 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.67 
 
 
243 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.69 
 
 
234 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.25 
 
 
242 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  46.01 
 
 
254 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.48 
 
 
244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.62 
 
 
238 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.48 
 
 
244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.48 
 
 
244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 
246 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.01 
 
 
254 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.04 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.23 
 
 
243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 
309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.36 
 
 
243 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.74 
 
 
301 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  43.05 
 
 
301 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.15 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.65 
 
 
230 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.48 
 
 
307 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.42 
 
 
301 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  43.27 
 
 
243 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
303 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 
304 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
303 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
265 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.03 
 
 
301 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  40.5 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.32 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 
303 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  43 
 
 
307 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.05 
 
 
240 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.06 
 
 
262 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.39 
 
 
242 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  42.11 
 
 
253 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.4 
 
 
263 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 
250 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.2 
 
 
238 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.23 
 
 
237 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
246 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
253 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.42 
 
 
238 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.91 
 
 
355 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
250 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.98 
 
 
299 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.41 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.41 
 
 
238 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
222 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.86 
 
 
241 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.43 
 
 
278 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  40.67 
 
 
239 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  40.67 
 
 
239 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
222 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
222 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0220  putative transport-related membrane protein  39.91 
 
 
221 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
222 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.16 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.65 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.2 
 
 
236 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.44 
 
 
222 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.7 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.7 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.7 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.7 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.7 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.7 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.91 
 
 
234 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 
224 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>