262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0028 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 147 aa  299  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  48.59 
 
 		 399 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  47.18 
 
 		 414 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  47.18 
 
 		 413 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 		 414 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 		 414 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  46.48 
 
 		 413 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 		 400 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  44.52 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  47.45 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.14 
 
 		 335 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  47.1 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  45.99 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  46.9 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  42.86 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  48.53 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  47.86 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  47.86 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 		 150 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 		 158 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  39.72 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 		 402 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  47.18 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  45.59 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  38.35 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  43.36 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  42.42 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  38.62 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  42.07 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  44.7 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  41.5 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  42.96 
 
 		 150 aa  93.2  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  47.76 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  37.5 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  33.11 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3036  GCN5-related N-acetyltransferase  47.5 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  39.05 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  30.25 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 		 212 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  40.62 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02305  N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4216  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  31.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  31.08 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  31.06 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.655717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>