36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0585 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  100 
 
 		 266 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  43.7 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  43.7 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  36.82 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  36.82 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  36.18 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  35.86 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  32.55 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  32.55 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  36.69 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  27.8 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  33.33 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  33.61 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  28.46 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  43.16 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  34.29 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  32.72 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  35.77 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  35.19 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  30.56 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  34.09 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  33.94 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  30.23 
 
 		 115 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  32.12 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  31.39 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  32.22 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  31.91 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  34.12 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  28.3 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  29.75 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  31.25 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  31.25 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  27.03 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  29.37 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>