77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0058 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 		 316 aa  653    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  53.55 
 
 		 317 aa  354  8.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  27.52 
 
 		 1014 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  27.69 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 630 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  26.88 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  26.42 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  26.04 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  27.13 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  24.31 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  24.82 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  24.55 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  25.2 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0994  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.58 
 
 		 759 aa  80.1  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.624995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2334  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  22.68 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  25.78 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  25.37 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  26.05 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  27.85 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  25.74 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.74 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  22.64 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  27.22 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  25.74 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  25.74 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.37 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.91 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  22.02 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  25.74 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0995  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.48 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.215731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  24.23 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  23.59 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0711  glycosyl transferase family protein  21.08 
 
 		 497 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  29.32 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  24.3 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  20.76 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  24.73 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.74 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2104  glycosyl transferase family 8  25.53 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 401 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  24.57 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.26 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  29.73 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  19.23 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  24.32 
 
 		 615 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  23.11 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  21.79 
 
 		 697 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  23.11 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  23.11 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  23.11 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  23.11 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  22.63 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  21.3 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  24.02 
 
 		 602 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  21.3 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  21.3 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  23.11 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.25 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  21.3 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  21.3 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  23.11 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>