21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1652 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  100 
 
 
146 aa  305  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  39.08 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  29.79 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  35.94 
 
 
299 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  37.5 
 
 
299 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  35.37 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  32.89 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  30.85 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  31.4 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  31.87 
 
 
138 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  34.78 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  31.4 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  34.78 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  37.5 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  37.5 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  33.33 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  31.33 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  29.29 
 
 
240 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  28.41 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  25.27 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  32 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>